Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

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Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Plekha5-206ENSMUST00000203774 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Spata45-202ENSMUST00000192151 443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rnf17Q99MV7 Gm43551-201ENSMUST00000197221 440 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm42620-201ENSMUST00000197715 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm3922-201ENSMUST00000200519 435 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Olfr371-202ENSMUST00000218663 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm40578-202ENSMUST00000221429 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Yipf7-201ENSMUST00000031045 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Dbil5-201ENSMUST00000040806 581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm10015-201ENSMUST00000072570 465 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Cox7a1-201ENSMUST00000098594 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm15535-202ENSMUST00000148478 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 AC187103.1-202ENSMUST00000223904 1536 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf17Q99MV7 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm33180-201ENSMUST00000217109 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf17Q99MV7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf17Q99MV7 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf17Q99MV7 Tmem89-201ENSMUST00000026744 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Rpl6-201ENSMUST00000031617 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Tpm1-203ENSMUST00000050905 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf17Q99MV7 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf17Q99MV7 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm42962-201ENSMUST00000201966 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Wdr20rt-202ENSMUST00000221658 1570 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf17Q99MV7 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf17Q99MV7 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gng12-207ENSMUST00000114228 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm12619-201ENSMUST00000117369 385 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf17Q99MV7 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf17Q99MV7 Gm21919-201ENSMUST00000185653 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm28446-201ENSMUST00000186508 694 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm28680-201ENSMUST00000186743 480 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm21824-201ENSMUST00000186810 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm21862-201ENSMUST00000186957 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm21796-201ENSMUST00000187116 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm21795-201ENSMUST00000187263 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm28814-201ENSMUST00000187334 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm21720-201ENSMUST00000187428 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm20827-201ENSMUST00000187928 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm21766-201ENSMUST00000187962 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm21837-201ENSMUST00000188117 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm21829-201ENSMUST00000188787 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm21892-201ENSMUST00000189182 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm21777-201ENSMUST00000189307 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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