Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ttc39cQ8VE09 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms