Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Plac9b-201ENSMUST00000100809 388 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm24066-201ENSMUST00000104515 131 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Fgf1-203ENSMUST00000117566 418 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm8864-201ENSMUST00000118653 1010 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Rpl7a-ps11-201ENSMUST00000118791 801 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm5766-202ENSMUST00000161633 799 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm20474-201ENSMUST00000180089 596 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm17797-201ENSMUST00000182175 997 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm5291-201ENSMUST00000201965 899 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 AC153153.1-201ENSMUST00000225803 793 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm16477-201ENSMUST00000085365 801 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Mrps14-202ENSMUST00000097193 787 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Mcu-201ENSMUST00000009791 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Tulp2-203ENSMUST00000107758 1597 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Lyrm1-204ENSMUST00000106518 875 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Wfdc2-203ENSMUST00000109345 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Mrps33-202ENSMUST00000114797 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm7781-201ENSMUST00000117258 788 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm44805-201ENSMUST00000127648 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm12326-201ENSMUST00000132986 618 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Muc2-202ENSMUST00000167366 711 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 2010008C14Rik-201ENSMUST00000203956 593 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm6859-201ENSMUST00000218614 989 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 AC159006.3-201ENSMUST00000226918 664 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm26440-201ENSMUST00000082591 129 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm42849-201ENSMUST00000202834 1584 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms