Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms