Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXG3

Ift57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift57Q8BXG3 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift57Q8BXG3 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift57Q8BXG3 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift57Q8BXG3 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift57Q8BXG3 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift57Q8BXG3 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift57Q8BXG3 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift57Q8BXG3 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift57Q8BXG3 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift57Q8BXG3 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift57Q8BXG3 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift57Q8BXG3 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ift57Q8BXG3 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ift57Q8BXG3 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ift57Q8BXG3 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift57Q8BXG3 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms