Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Gm28047Q3US59 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Gm28047Q3US59 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
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Gm28047Q3US59 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm28047Q3US59 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm28047Q3US59 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm28047Q3US59 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm28047Q3US59 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm28047Q3US59 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm28047Q3US59 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm28047Q3US59 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm28047Q3US59 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm28047Q3US59 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm28047Q3US59 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm28047Q3US59 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28047Q3US59 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28047Q3US59 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28047Q3US59 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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