Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

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Length 807 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Perm1Q149B8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Perm1Q149B8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Perm1Q149B8 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Perm1Q149B8 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Perm1Q149B8 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Perm1Q149B8 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Perm1Q149B8 Gm29328-212ENSMUST00000209182 1168 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms