Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Wfdc16-201ENSMUST00000109336 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm5054-201ENSMUST00000119351 453 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm15798-201ENSMUST00000120082 408 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 1700057H15Rik-202ENSMUST00000143859 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm3752-202ENSMUST00000167833 450 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm10128-201ENSMUST00000171360 615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Pkib-204ENSMUST00000175852 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm2956-202ENSMUST00000178722 450 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm24466-201ENSMUST00000179978 109 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm10340-202ENSMUST00000188235 615 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm9771-201ENSMUST00000198267 1137 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm7727-201ENSMUST00000219830 671 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 AC165249.1-203ENSMUST00000219976 392 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 AC140393.4-201ENSMUST00000226994 765 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 1700013G24Rik-201ENSMUST00000048893 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Smim4-201ENSMUST00000049732 311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Ppp1r9a-206ENSMUST00000175962 3769 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm13551-201ENSMUST00000121286 430 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm12977-201ENSMUST00000133742 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm18783-201ENSMUST00000220465 1151 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 CT025538.1-201ENSMUST00000223638 369 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Elobl-202ENSMUST00000082339 300 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Vmn1r44-203ENSMUST00000226120 1772 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Prss23-204ENSMUST00000207932 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm5432-201ENSMUST00000180759 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm13527-201ENSMUST00000117926 691 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm5652-201ENSMUST00000182336 1008 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm37144-201ENSMUST00000195445 1150 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Zfp389-202ENSMUST00000224437 1234 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Actl9-201ENSMUST00000174088 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Phactr1-214ENSMUST00000149235 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm43362-201ENSMUST00000198192 2470 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Fthl17b-201ENSMUST00000105006 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm15353-201ENSMUST00000110860 702 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm14834-201ENSMUST00000119416 795 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Rpl7a-ps12-201ENSMUST00000120384 794 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms