Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Igf2bp3-201ENSMUST00000031838 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Myo1a-201ENSMUST00000079590 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm19656-201ENSMUST00000208543 4610 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Tacc2-203ENSMUST00000084513 9029 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Tdp1-201ENSMUST00000021594 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Park2-209ENSMUST00000191124 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Enox2-202ENSMUST00000114911 2623 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Numb-210ENSMUST00000154043 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Decr1-201ENSMUST00000029877 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Duoxa1-203ENSMUST00000110538 2467 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Olfr287-204ENSMUST00000170618 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Serpinc1-201ENSMUST00000064725 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Fbxl20-201ENSMUST00000103143 8601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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