Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RarbP22605 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RarbP22605 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RarbP22605 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RarbP22605 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RarbP22605 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RarbP22605 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RarbP22605 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RarbP22605 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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RarbP22605 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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