Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Rimbp2-201ENSMUST00000111346 4264 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 L3mbtl3-201ENSMUST00000040219 4572 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 D430042O09Rik-203ENSMUST00000124223 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Slc5a9-203ENSMUST00000102721 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Dgkd-201ENSMUST00000027517 5695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Mettl14-202ENSMUST00000090371 7197 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ank3-206ENSMUST00000092434 5886 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ank3-203ENSMUST00000092431 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Tm4sf1-201ENSMUST00000029376 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms