Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms