Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 9130221F21Rik-201ENSMUST00000206867 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Xrcc2-201ENSMUST00000030773 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Uox-201ENSMUST00000029837 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Gm3239L7N2D9 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 D130017N08Rik-202ENSMUST00000180951 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Gm3239L7N2D9 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Gm3239L7N2D9 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm3239L7N2D9 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm3239L7N2D9 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm3239L7N2D9 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm3239L7N2D9 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm3239L7N2D9 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm3239L7N2D9 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm3239L7N2D9 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm3239L7N2D9 Pla2g4e-201ENSMUST00000090071 4477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm3239L7N2D9 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm3239L7N2D9 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Hsp90aa1-202ENSMUST00000094361 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Bcl2l11-201ENSMUST00000019281 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Zfp114-201ENSMUST00000086010 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms