Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm2492-201ENSMUST00000221355 1394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm10406-201ENSMUST00000100895 1813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm11231-201ENSMUST00000117895 1706 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Apoo-201ENSMUST00000113895 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm15727-201ENSMUST00000122416 437 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm13372-201ENSMUST00000123129 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm18299-201ENSMUST00000192026 636 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm37486-201ENSMUST00000195663 405 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Olfr139-203ENSMUST00000206280 1059 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Pttg1-201ENSMUST00000020685 634 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 AC116589.8-201ENSMUST00000220945 364 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 AC116797.2-203ENSMUST00000225290 565 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Krtap21-1-201ENSMUST00000078422 748 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Rpl15-ps3-201ENSMUST00000088480 615 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Rdh7-201ENSMUST00000047199 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 H2-DMb2-202ENSMUST00000171231 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Ccl6-201ENSMUST00000019071 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Pde7a-203ENSMUST00000121951 382 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm15664-201ENSMUST00000160167 184 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm17250-201ENSMUST00000180494 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Mir6981-201ENSMUST00000184293 115 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 AC156633.1-201ENSMUST00000215971 614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Syna-201ENSMUST00000149604 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Olfr30-202ENSMUST00000215691 2404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Ifitm7-202ENSMUST00000178021 1823 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Krtap29-1-201ENSMUST00000105051 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm16210-201ENSMUST00000122161 610 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm28381-201ENSMUST00000188403 193 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm5259-201ENSMUST00000191231 800 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Crip1-206ENSMUST00000200553 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Crip1-201ENSMUST00000006523 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm38309-201ENSMUST00000192063 1518 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 AC154575.1-201ENSMUST00000227166 1474 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Slc25a14-208ENSMUST00000177710 1516 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Actg2-202ENSMUST00000121731 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Plxna4os3-201ENSMUST00000127668 269 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm13629-201ENSMUST00000141149 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm15351-202ENSMUST00000150686 271 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 1700019D03Rik-206ENSMUST00000190831 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Spin3-ps-201ENSMUST00000192825 770 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms