Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms