Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms