Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3238W4VSP7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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