Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ap3b1Q9Z1T1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ap3b1Q9Z1T1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ap3b1Q9Z1T1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ap3b1Q9Z1T1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ap3b1Q9Z1T1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ap3b1Q9Z1T1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ap3b1Q9Z1T1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ap3b1Q9Z1T1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ap3b1Q9Z1T1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ap3b1Q9Z1T1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ap3b1Q9Z1T1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ap3b1Q9Z1T1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ap3b1Q9Z1T1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ap3b1Q9Z1T1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ap3b1Q9Z1T1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ap3b1Q9Z1T1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ap3b1Q9Z1T1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ap3b1Q9Z1T1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ap3b1Q9Z1T1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ap3b1Q9Z1T1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ap3b1Q9Z1T1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ap3b1Q9Z1T1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ap3b1Q9Z1T1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ap3b1Q9Z1T1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ap3b1Q9Z1T1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ap3b1Q9Z1T1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ap3b1Q9Z1T1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ap3b1Q9Z1T1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ap3b1Q9Z1T1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ap3b1Q9Z1T1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ap3b1Q9Z1T1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ap3b1Q9Z1T1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ap3b1Q9Z1T1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ap3b1Q9Z1T1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ap3b1Q9Z1T1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ap3b1Q9Z1T1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ap3b1Q9Z1T1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ap3b1Q9Z1T1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ap3b1Q9Z1T1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ap3b1Q9Z1T1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ap3b1Q9Z1T1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ap3b1Q9Z1T1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms