Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lhx9Q9WUH2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lhx9Q9WUH2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lhx9Q9WUH2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lhx9Q9WUH2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lhx9Q9WUH2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lhx9Q9WUH2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lhx9Q9WUH2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lhx9Q9WUH2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lhx9Q9WUH2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lhx9Q9WUH2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lhx9Q9WUH2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lhx9Q9WUH2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lhx9Q9WUH2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lhx9Q9WUH2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lhx9Q9WUH2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lhx9Q9WUH2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lhx9Q9WUH2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lhx9Q9WUH2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lhx9Q9WUH2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lhx9Q9WUH2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lhx9Q9WUH2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lhx9Q9WUH2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lhx9Q9WUH2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lhx9Q9WUH2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lhx9Q9WUH2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lhx9Q9WUH2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lhx9Q9WUH2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lhx9Q9WUH2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lhx9Q9WUH2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lhx9Q9WUH2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lhx9Q9WUH2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Lhx9Q9WUH2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lhx9Q9WUH2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lhx9Q9WUH2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms