Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTY1

Pdcd7, Programmed cell death protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd7Q9WTY1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdcd7Q9WTY1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdcd7Q9WTY1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdcd7Q9WTY1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdcd7Q9WTY1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdcd7Q9WTY1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdcd7Q9WTY1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pdcd7Q9WTY1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdcd7Q9WTY1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdcd7Q9WTY1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdcd7Q9WTY1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcd7Q9WTY1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcd7Q9WTY1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcd7Q9WTY1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcd7Q9WTY1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcd7Q9WTY1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcd7Q9WTY1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcd7Q9WTY1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcd7Q9WTY1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcd7Q9WTY1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcd7Q9WTY1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcd7Q9WTY1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcd7Q9WTY1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcd7Q9WTY1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcd7Q9WTY1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcd7Q9WTY1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcd7Q9WTY1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcd7Q9WTY1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcd7Q9WTY1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcd7Q9WTY1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcd7Q9WTY1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcd7Q9WTY1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcd7Q9WTY1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcd7Q9WTY1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcd7Q9WTY1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcd7Q9WTY1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcd7Q9WTY1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcd7Q9WTY1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcd7Q9WTY1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcd7Q9WTY1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms