Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms