Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tnnt3Q9QZ47 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Tnnt3Q9QZ47 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms