Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYC3

Bhlha15, Class A basic helix-loop-helix protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha15Q9QYC3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlha15Q9QYC3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms