Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzd4Q9QY39 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms