Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp3Q9QY23 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms