Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms