Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Limd1Q9QXD8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms