Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpc5Q9QX29 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms