Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms