Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gkap1Q9JMB0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gkap1Q9JMB0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gkap1Q9JMB0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gkap1Q9JMB0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Gkap1Q9JMB0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gkap1Q9JMB0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gkap1Q9JMB0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gkap1Q9JMB0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gkap1Q9JMB0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gkap1Q9JMB0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gkap1Q9JMB0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gkap1Q9JMB0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gkap1Q9JMB0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gkap1Q9JMB0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gkap1Q9JMB0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gkap1Q9JMB0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gkap1Q9JMB0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gkap1Q9JMB0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gkap1Q9JMB0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gkap1Q9JMB0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gkap1Q9JMB0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gkap1Q9JMB0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gkap1Q9JMB0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gkap1Q9JMB0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms