Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ybx3Q9JKB3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ybx3Q9JKB3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ybx3Q9JKB3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ybx3Q9JKB3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ybx3Q9JKB3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ybx3Q9JKB3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ybx3Q9JKB3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ybx3Q9JKB3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ybx3Q9JKB3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ybx3Q9JKB3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ybx3Q9JKB3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ybx3Q9JKB3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ybx3Q9JKB3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ybx3Q9JKB3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ybx3Q9JKB3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ybx3Q9JKB3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ybx3Q9JKB3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ybx3Q9JKB3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ybx3Q9JKB3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms