Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gfra4Q9JJT2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms