Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT0

Rcl1, RNA 3'-terminal phosphate cyclase-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcl1Q9JJT0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rcl1Q9JJT0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcl1Q9JJT0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms