Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJQ0

Pigb, GPI mannosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PigbQ9JJQ0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PigbQ9JJQ0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PigbQ9JJQ0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PigbQ9JJQ0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PigbQ9JJQ0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PigbQ9JJQ0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PigbQ9JJQ0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PigbQ9JJQ0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PigbQ9JJQ0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PigbQ9JJQ0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PigbQ9JJQ0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PigbQ9JJQ0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PigbQ9JJQ0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PigbQ9JJQ0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PigbQ9JJQ0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PigbQ9JJQ0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PigbQ9JJQ0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PigbQ9JJQ0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PigbQ9JJQ0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PigbQ9JJQ0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PigbQ9JJQ0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PigbQ9JJQ0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PigbQ9JJQ0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PigbQ9JJQ0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PigbQ9JJQ0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PigbQ9JJQ0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PigbQ9JJQ0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PigbQ9JJQ0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PigbQ9JJQ0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PigbQ9JJQ0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PigbQ9JJQ0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PigbQ9JJQ0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PigbQ9JJQ0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PigbQ9JJQ0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms