Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJA4

Wdr12, Ribosome biogenesis protein WDR12, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr12Q9JJA4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr12Q9JJA4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr12Q9JJA4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr12Q9JJA4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr12Q9JJA4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr12Q9JJA4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr12Q9JJA4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr12Q9JJA4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr12Q9JJA4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr12Q9JJA4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr12Q9JJA4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr12Q9JJA4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr12Q9JJA4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr12Q9JJA4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr12Q9JJA4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr12Q9JJA4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr12Q9JJA4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr12Q9JJA4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr12Q9JJA4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr12Q9JJA4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr12Q9JJA4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr12Q9JJA4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr12Q9JJA4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr12Q9JJA4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr12Q9JJA4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr12Q9JJA4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr12Q9JJA4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr12Q9JJA4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr12Q9JJA4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr12Q9JJA4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr12Q9JJA4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr12Q9JJA4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr12Q9JJA4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms