Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rpf2Q9JJ80 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms