Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ72

Rprm, Protein reprimo, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RprmQ9JJ72 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RprmQ9JJ72 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms