Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI7

Exosc9, Exosome complex component RRP45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc9Q9JHI7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Exosc9Q9JHI7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms