Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ush1cQ9ES64 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms