Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Q9D8Q6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D8Q6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Q9D8Q6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D8Q6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D8Q6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D8Q6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D8Q6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D8Q6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D8Q6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D8Q6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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