Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tube1Q9D6T1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms