Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G3

2900055J20Rik, RIKEN cDNA 2900055J20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2900055J20RikQ9D6G3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
2900055J20RikQ9D6G3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms