Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Rab11fip1Q9D620 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Rab11fip1Q9D620 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab11fip1Q9D620 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Rab11fip1Q9D620 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Rab11fip1Q9D620 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Rab11fip1Q9D620 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Rab11fip1Q9D620 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Rab11fip1Q9D620 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Rab11fip1Q9D620 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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