Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms