Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms