Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubgcp4Q9D4F8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms