Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Mms19Q9D071 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mms19Q9D071 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mms19Q9D071 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mms19Q9D071 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mms19Q9D071 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mms19Q9D071 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mms19Q9D071 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mms19Q9D071 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mms19Q9D071 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mms19Q9D071 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mms19Q9D071 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mms19Q9D071 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mms19Q9D071 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mms19Q9D071 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mms19Q9D071 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mms19Q9D071 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Mms19Q9D071 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms