Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms