Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYD3

Crtap, Cartilage-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrtapQ9CYD3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CrtapQ9CYD3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CrtapQ9CYD3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms