Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY16

Mrps28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps28Q9CY16 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrps28Q9CY16 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrps28Q9CY16 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrps28Q9CY16 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrps28Q9CY16 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrps28Q9CY16 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrps28Q9CY16 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrps28Q9CY16 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrps28Q9CY16 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrps28Q9CY16 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrps28Q9CY16 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrps28Q9CY16 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrps28Q9CY16 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrps28Q9CY16 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrps28Q9CY16 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrps28Q9CY16 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrps28Q9CY16 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrps28Q9CY16 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrps28Q9CY16 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrps28Q9CY16 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrps28Q9CY16 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrps28Q9CY16 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrps28Q9CY16 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrps28Q9CY16 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrps28Q9CY16 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Mrps28Q9CY16 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Mrps28Q9CY16 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrps28Q9CY16 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrps28Q9CY16 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrps28Q9CY16 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrps28Q9CY16 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrps28Q9CY16 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrps28Q9CY16 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms